Plateforme d'imagerie - Merimage

La plateforme Merimage est orientée principalement dans le domaine de la mer et de la santé. Les prestations sont proposées dans le cadre de l'infrastructure EMBRC-France.

Mission

La plateforme d’imagerie Merimage a pour mission d’offrir un accès optimal à des équipements de microscopie optique et de microscopie électronique, un accompagnement, une expertise technique et scientifique dans le domaine de la biologie marine. Elle dessert une communauté locale, nationale et internationale. Merimage garantie la qualité des services, favorise l’innovation méthodologique et l’accompagnement des utilisateurs par la formation et le conseil.

Activités principales

  • Expertise et Développement méthodologique
    - Participer à des projets de recherche appliquée et de développement en microscopie.
    - Collaborer à la mise en œuvre de protocoles complexes d’imagerie et à l’intégration de nouvelles techniques de microscopie
     
  • Formation et Accompagnement scientifique et technique
    - Organiser des ateliers et journées de formation pour la communauté scientifique.
     
  • Acquisition et analyse d’images
    - Réaliser des observations et des acquisitions d’images en microscopie optique (fluorescence, confocale, super-résolution) et électronique (MET, MEB).
    - Analyse des données d’imagerie quantitatives et qualitative, interprétation des résultats
     

Réseaux & Infrastructure de recherche

Prestations

Vous pouvez prendre un rendez-vous avec l'ingénieur de la plate-forme d’imagerie pour discuter de la faisabilité de l’expérience et fixer les modalités de réalisation du travail

Microscopie électronique

  • Analyse ultrastructurale par différentes méthodes de préparation d’échantillons et observation en MET (Epon, Spurr)
  • Cryosubstitution d’échantillons préalablement cryofixés
  • Ultra(cryo)microtomie : coupes semi-fines et ultra fines, cryocoupes
  • Contraste des coupes à l’acétate d’uranyle et au plomb
  • Coloration négative
  • Immunolocalisation simples ou multiples à l’or colloidal sur des coupes réalisées à partir de blocs inclus en LRWhite ou Lowicryl ou sur des cryo coupes
  • Etude de l’endocytose par internalisation de traceurs denses aux électrons
  • Hybridation in situ

Microscopie optique

  • Visualisation et localisation cellulaire de molécules fluorescentes
  • Coupe en Z dans la profondeur de l’échantillon
  • Analyse et visualisation de processus dynamiques (Time lapse)
  • Analyse spectrale
  • Mosaïque
  • Traitement et analyses d’images

Formation et mise à disposition des équipements du pôle optique

Les demandes de prestation ou de formation doivent être accompagnées du règlement intérieur visé par le responsable de l’équipe demandeuse. 

 

Equipements

Merimage dispose d’un large panel d’équipements

  • Microscopie électronique
  • Microscope Electronique en Transmission, JEOL 1400, équipé de deux caméras haute définition de chez Gatan pilotées par Digital Micrograph,
  • Porte échantillon Cryo : Cryo-microscopie électronique
  • Microscope électronique à balayage Phenon,
  • Equipements de préparation des échantillons : ultra-cryo-microtome Leica, automate de cryosubstitution AFS2 Leica, appareil de contournement du point critique Baltec SPD030.
  • Microscopie optique : les équipements peuvent être utilisés de manière autonome par des utilisateurs ayant suivi une formation adaptée.
  • Microscope confocal inversé TCS SP5 AOBS Leica avec un scanner conventionnel et résonnant équipés de lasers 405, 488, 561 et 633
  • Vidéomicroscope DMI6000B Leica
  • Loupe Discovery Zeiss
  • Microscope confocal TCS SP8 Leica
  • Poste d’analyse : imaris
Ectocarpus en MET

Microscope Electronique en Transmission

Photo de l’algue brune Ectocarpus en microscopie électronique en transmission

Lierre sauvage en MEB

Microscope électronique à balayage Phenon

Photo de lierre sauvage Glecoma en microscopie électronique à balayage

Equipe