Plateforme de métabolomique - METABOMER
La plateforme de Spectrométrie de Masse METABOMER propose des services et études par spectrométrie de masse, depuis l’atome jusqu’à la macromolécule. Notre spécificité réside dans notre travail sur des matrices marines. Les prestations sont proposées dans le cadre de l'infrastructure EMBRC-France.
Mission
La plateforme Metabomer propose des équipements scientifiques de spectrométrie de masse pour des investigations du métabolisme à travers la caractérisation de petites molécules (<1200Da). La spécificité de son offre repose sur une spécialisation autour des matrices d’origine marine et son engagement dans le développement de la métabolomique marine.
La plateforme METABOMER est répartie en 3 pôles analytiques : Spectrométries de Masse Basse Résolution, Haute Résolution et Isotopique.
Le personnel est composé d’un responsable plateforme et d’une assistante ingénieure en interaction avec une responsable scientifique.
Infrastructures de recherche
Autres labellisations
REsaux CollAboratif des PlateformeS de l’ASU (RECAPS)
Société Française des IsotopeS (SFIS)
Réseau Francophone en Métabolomique et Fluxomique (RFMF)
Prestations
La plateforme est ouverte à la communauté scientifique, publique et privée, dédiée principalement à l’étude des organismes et des écosystèmes marins. Elle est aussi disponible à d’autres collaborations s’ils restent dans ses domaines d’expertise.
Préparation d’échantillons à la demande
• Extraction des métabolites d’un échantillon à partir de poudre lyophilisée
• Passage automatisé sur Autotrace de Dionex. Extraction ou purification par SPE.
• Dérivation des métabolites pour l’analyse en chromatographie en phase gazeuse
Analyses
- Analyse métabolomique d’échantillons par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse.
- Analyse métabolomique d’échantillons en chromatographie liquide ultra haute performance couplée à la spectrométrie de masse haute résolution.
- Dosage de composés par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse.
Nos équipements
Chromatographie en Phase Gazeuse (GC) couplée à un spectromètre de Masse de type quadripôle (MS)
Membres de la plateforme
Gabriel MARKOV
Co-head of the ABIE team and scientific manager of the Metabomer platform
Chargé de recherche CNRS
En savoir plusLabellisation et réseaux
Biogenouest
Réseau Grand-Ouest de Métabolomique Corsaire
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