Présentation - Plateforme Genomer
La plateforme Genomer propose la réalisation et l'accompagnement de projets de séquençage.
Les missions de la Plateforme Genomer sont de :
• mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD
• proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de vos projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG
Elle fait partie intégrante de l’axe Biogenouest Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.
La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBISA depuis avril 2012.
La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : EMBRC FR.
Exemple d'application:
Identification bactériennes en symbiose avec les frénulés: espèces de vers marins dans 2 zones de la mer de Barents
- échantillons ADNr 16S
- génomes bactériens
Caractérisation des populations virales présentes dans l’huitre Crassostrea
- génomes viraux
Caractérisation de génomes bactériens associés à Ectocarpus et Laminaria
- génomes bactériens
Analyse de la communauté bactérienne associée aux tissus de l'algue brune Laminaria hyperborea en cours de dégradation
- échantillons ADNr 16S
Projet ALGOLIFE: Etude du microbiote intestinal de poulet de chair suite à l'administration d'additif à base d'algue
- échantillons ADNr 16S
Le personnel est composé d'une responsable plate-forme et d'une assistante ingénieur en interaction avec une responsable scientifique.
Ce service est doté d'un comité d'animation composé de représentants issus de chaque unité de la station afin d'avoir une reflexion globale sur les projets de développement.
Un comité utilisateur est organisé une fois par an. Il permet d'échanger sur le fonctionnement de la plateforme, du renouvellement des équipements, des projets et des développements.
La plateforme Genomer respecte les exigences du référenciel ISO9001-V2008.
Depuis 2015, la plateforme est engagée dans une démarche qualité commune au sein des 3 stations Marines d’EMBRC-FR : Banyuls-sur Mer, Villefranche-sur-Mer et Roscoff.