Maître de conférences Sorbonne Université

Jean Mary

Principaux intérêts scientifiques

Je m’intéresse à l’adaptation des invertébrés hydrothermaux aux conditions de température des sources hydrothermales profondes dans le contexte de l’histoire évolutive de ces espèces. J’utilise des méthodes éprouvées de biochimie des protéines et de biophysique au service d’une question relevant de la problématique de l’évolution des espèces. J’ai comme modèle la famille des Alvinellidae.

Les Alvinellidae constituent une famille de vers endémique des sources hydrothermales du Pacifique principalement. Cette famille, compte une quinzaine d’espèces regroupées en deux genres, les Alvinella et les Paralvinella. Parmi ces espèces, certaines vivent au plus proche de la source d’émission du fluide hydrothermal et supportent donc des température élevées pour des métazoaires (Alvinella pompejana, Paralvinella sulfincola…) tandis que d’autres s’en tiennent plus éloignées (Paralvinella grasslei, Paralvinella palmiformis…). Nous corrélons la stabilité conformationnelle des protéines d’un organisme à la température de son milieu de vie. Certaines espèces sont plus thermophiles que d’autres. Nous essayons de comprendre comment ce caractère de thermophilie a évolué au cours de l’histoire de cette lignée. Pour cela nous procédons à la reconstruction de séquences ancestrales de protéines à différents nœuds clés de la phylogénie et nous testons la thermo-stabilité de ces protéines. L’objectif final est de déterminer si l’organisme ancêtre de cette lignée état thermophile ou non.

 

Experiences

* Participation à des campagnes océanographiques :

2019 Chubacarc (mai 2019), Bassins arrière-Arc Pacifique Sud Ouest, chef de mission D. Jollivet - NO l’Atalante / ROV.

2013 BioBaz, Ride Médio-Atlantique, chef de mission F Lallier – NO Pourquoi Pas / ROV.

2012 MESCAL-2, Ride Pacifique orientale (EPR), chef de mission N. Le Bris – NO l’Atalante / Nautile.

2010 MESCAL-1, Ride Pacifique orientale (EPR), chef de mission F Lallier – NO l’Atalante / Nautile.

 

* Je suis co-responsable du parcours de licence de biologie – Modélisation et Analyse de Données de Sorbonne Université et dispensé à la station biologique de Roscoff. J’y enseigne, la chimie, la thermodynamique, l’enzymologie et le métabolisme.

 

 

Publications

* Bioy A., Le Port A.S., Verheye M., Faure B., Mary J. and Jollivet D. (2022) Balanced  polymorphism at the Pgm-1 locus of the Pompeii worm Alvinella pompejana and its variant adaptability is only governed by two QE mutations at linked sites. Gene, 13 : 206.

* Détrée C., Haddad I., Demey-Thomas E., Vinh J., Lallier F.H., Tanguy A., Mary J. (2019) Global host molecular perturbations upon in situ loss of bacterial endosymbionts in the deep-sea mussel Bathymodiolus azoricus assessed using proteomics and transcriptomics. BMC Genomics, 20. DOI : 10.1186/s12864-019-5456-0.

* Détrée C., Lallier F.H., Tanguy A., Mary J. (2017) Identification and gene expression of multiple peptidoglycan recognition proteins (PGRPs) in the deep-sea mussel Bathymodiolus azoricus, involvement in symbiosis? Comp. Biochem. Physiol. Part B, 207 : 1-8.

* Fontanillas E, Galzitskaya O.V., Lecompte  O., Lobanov M.Y., Tanguy A., Mary J., Girguis P.R., Hourdez S., Jollivet D. (2017) Proteome evolution of deep-sea hydrothermal vent alvinellid polychaetes supports the ancestry of thermophily and subsequent adaptation to cold in some lineages. Genome Biol. Evol. evw298.

* Détrée C., Chabenat A., Lallier FH., Satoh N., Shoguchi E., Tanguy A., Mary J. (2016) Multiple i-type lysozymes in the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus azoricus and their role in symbiotic plasticity. Plos One 11 : e0148988.

* Bruneaux M., Mary J., Verheye M., Lecompte O., Jollivet D., Tanguy A. (2013) Detection and  characterization of mutations responsible for allele-specific protein thermostabilities at the Mn-superoxide dismutase gene in the deep-sea hydrothermal vent polychaete Alvinella pompejana. J. Mol. Evol. 76 :295-310.

* Jollivet D., Mary J., Gagnière N., Tanguy A., Fontanillas E., Boutet I., Hourdez, S., Segurens B., Weissenbach J., Poch O., Lecompte O. (2012) Proteome adaptation to high temperatures in ectothermic vent metazoa Pompeii worm. Plos One 7 : e31150 10.1371.

* Gagnière N., Jollivet D., Bigot Y., Boutet, I., Busso D., Chénais B., Gaill F., Higuet D., Hourdez S., Knoops B., Lallier F., Leize-Wagner E., Mary J., Moras D., Rees J.-F., Shillito B., Segurens B., Tanguy A., Thierry J.-C., Weissenbach J., Zal F., Poch O., Lecompte O. (2010) Insights into metazoan evolution from Alvinella pompejana cDNA libraries. BMC Genomics 11: 634 10.1186/1471-2164-11-634.

* Mary J., Rogniaux H., Rees JF., Zal F. (2010) Response of Alvinella pompejana to variable oxygen stress: a proteomic approach. Proteomics 10, 2250-2258.

* Le HT, Chaffotte A., Demey-Thomas E., Vinh J., Friguet B., Mary J. (2009) Impact of hydrogen peroxide on the activity, structure and conformational stability of the oxidized protein repair enzyme methionine sulfoxide reductase A. J. Mol. Biol. 393, 58-66.