Service cristallographie
La cristallographie est la science qui se consacre à l'étude des cristaux à l'échelle atomique. Les propriétés physico-chimiques d'un cristal sont étroitement liées à l'arrangement spatial des atomes dans la matière. L'état cristallin est défini par un caractère périodique et ordonné à l'échelle atomique ou moléculaire. Le cristal est obtenu par translation dans toutes les directions d'une unité de base appelée maille élémentaire. Le service cristallographie de la plateforme CristalO est composé des équipements suivants :
Diffractomètre à rayons X de type Bruker X8-Proteum
Le diffractomètre X8-Proteum est constitué d’une source microfocus générant des rayons X (Incoatec IµSCu E025) opérant à une longueur d'onde de 1.54A. Le système de diffraction est complété par un goniomètre pour monocristaux quatre cercles Nonius Kappa avec détecteur CCD Bruker Platinum135, un générateur d'azote autonome NitroFlow Lab et une caméra .
PARC INFORMATIQUE
Le parc informatique de la plateforme est composé de 6 stations de travail Ubuntu (système d’exploitation GNU/Linux). Ces stations sont connectées entre elles via un espace de partage sur le serveur de la station biologique de Roscoff. Elles permettent l'accès aux données cristallographiques et l'utilisation de logiciels tels que Adxv, ALBULA, AlphaFold2, AMoRe, ARP/wARP, ATSAS, AutoDock Vina, BUSTER, CCP4, Coot, Foxtrot, iMOSFLM, NeXus, PHENIX, PyMOL, SHELX, UCSF Chimera, et XDS.
Le parc informatique de la plateforme est entrenu et géré par la plateforme ABiMS.