Proposition de thèse sur la "Modélisation de la contribution des alpha-cyanobactéries aux cycles biogéochimiques dans les océans (CyaNEMO)"

Ce projet de thèse vise à intégrer, dans le modèle climatique Nemo-PISCES, la diversité métabolique des alpha-cyanobactéries, les organismes photosynthétiques les plus abondants du milieu marin, afin d’améliorer la représentation des processus biotiques océaniques. Il repose sur la reconstruction de modèles métaboliques à l’échelle du génome des cyanobactéries (CyanoGEMs), la définition et la validation des niches métaboliques à partir de données expérimentales, ainsi que leur intégration dans des simulations biogéochimiques. En combinant des données génomiques et des approches écogénomiques, ce travail contribuera à proposer une nouvelle modélisation numérique fondée sur la programmation par contraintes pour mieux comprendre le rôle écologique des alpha-cyanobactéries et affiner les prédictions climatiques. Une demi-bourse de thèse est d’ores et déjà acquise pour ce sujet dans le cadre du projet ANR TaxCy et le complément fait l’objet de demandes en cours auprès de différentes sources de financement.

Sujet de thèse.pdf