Les microorganismes peuplant les océans présentent une très grande diversité qui reste aujourd’hui encore mal connue. Parmi les organismes eucaryotes, on compte un grand nombre de groupes de microalgues, de champignons, ciliés et autres organismes hétérotrophes. Les procaryotes rassemblent quant à eux de nombreuses lignées de bactéries photosynthétiques, (photo)hétérotrophes et d’archées. Enfin, les virus marins dont l’importance n’a été mise en évidence que depuis les années 1990, constituent aussi un compartiment extrêmement diversifié.
Ces microorganismes sont à l’origine de l’essentiel de l’activité biologique de l’océan mondial. A leur diversité taxonomique est associée une remarquable diversité fonctionnelle qui leur a permis de coloniser toutes les niches écologiques marines, et qui leur donne un rôle clef dans tous les cycles biogéochimiques de la planète.
L’étude des microorganismes a pendant longtemps été négligée car leur taille microscopique était souvent à l’origine d’obstacles techniques. Toutefois, les avancées récentes dans le domaine de la biologie moléculaire sensu lato, la génomique et la physiologie placent désormais l’étude des microorganismes à la pointe de la recherche moderne. Ces techniques ont permis d’ouvrir les portes d’un univers encore peu connu, dévoilant une diversité taxonomique très riche, de nombreuses interactions entre les microorganismes et des capacités d’adaptation surprenantes acquises au cours de l’évolution.
Diversité et interactions au sein du plancton photosynthétique
Adaptation à la niche écologique chez les picocyanobactéries
Dynamique et adaptation des procaryotes hétérotrophes
Comprendre comment les technologies de pointe permettent de dévoiler la diversité taxonomique, les interactions et les mécanismes d’adaptation à la niche écologique chez les microorganismes marins.