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● OBJECTIF GÉNÉRAL :
connaître les principales méthodes et les principaux outils d’analyse de données RNAseq de novo ou avec génomes de référence.
● OBJECTIFS OPÉRATIONNELS : UTILISER LES OUTILS D’ANALYSE DE DONNÉES RNASEQ DANS L’ENVIRONNEMENT GALAXY :
- Évaluer la qualité du jeu de données brutes,
- mettre en place des stratégies de nettoyage du jeu de données,
- assembler un jeu de données de novo et/ou remapper les jeux de données sur un génomes / transcriptome de référence,
- annoter un transcriptome,
- identifier les gènes différentiellement exprimés.
Publié sur Station Biologique de Roscoff - CNRS - Sorbonne Université (https://www.sb-roscoff.fr)
Liens
[1] http://www.fc.upmc.fr/fr/formations-en-sciences-et-pluridisciplinaires/racine-sciences-2019-2020/formation-qualifiante-FC6/sciences-technologies-sante-STS/analyse-rnaseq-sous-galaxy-program-analyse-rnaseq-sous-galaxy-2-2-3.html