Les études des microbiomes, communautés de microbes entretenant des interactions entre eux, avec leurs hôtes animaux et végétaux et leurs environnements, est en train de révéler l’importance évolutive, fonctionnelle, et écosystémique de ces créatures qui sont à la fois les plus abondantes et les plus anciennes formes de vies sur notre planète. De ce fait, les microbes figurent obligatoirement directement ou indirectement parmi les objets d’études de très nombreuses disciplines, qui pourraient sinon sembler essentiellement disjointes, puisque centrées sur des objets et des questions différentes. Les études des microbiomes apparaissent donc désormais non seulement comme sources d’inspiration et de connaissances nouvelles sur notre passé, mais aussi comme porteuses d’un potentiel transformatif encore à définir, voire comme des vecteurs d’unification insoupçonnées, vers, peut-être, ’une révolution microbiomique’ globale à venir, caractérisée par ce GDR, et qui changerait en profondeur les conceptions et pratiques juridiques, éthiques, médicales, biologiques, philosophiques, architecturales, politiques et artistiques.
Le GDR REVMICNAT, international et pluridisciplinaire, vise à rassembler les compétences d’une large diversité de collègues issus de d’équipes de recherche appartenant à des disciplines différentes dans lesquelles l’objet ‘microbiome’ prend progressivement (ou subitement) une place croissante, afin de réaliser une large réflexion collective, sur l’ampleur des conséquences des découvertes récentes réalisées sur les microbiomes.
Dans ce cadre, des experts reconnus de nombreuses disciplines interrogeront les conséquences de ces découvertes sur les concepts et sur les pratiques, identifiant un « avant » et un « après » la prise en compte des microbiomes dans leurs disciplines. Ainsi, des juristes, des philosophes des sciences et de l’environnement, des biologistes, des artistes, des architectes, et des vulgarisateurs scientifiques vont se rencontrer, partager leurs points de vue et leurs expériences pour évaluer ensemble les conséquences des découvertes autour des microbiomes. Cette croisée des regards permettra non seulement de dégager l’impact singulier des études sur les microbiomes sur chacune de ces disciplines, mais aussi d’identifier d’éventuelles tendances partagées induites par la prise en compte des microbiomes, tout en brossant une vision d’ensemble de la rénovation conceptuelle accompagnant la réalisation que les espèces, la nôtre incluse, ne vivent pas seules, mais toujours entourées et façonnées par des microbiomes.
Pour atteindre son objectif, REVMICNAT utilisera tous les moyens traditionnellement mis à disposition des GDR : échange d'étudiants entre laboratoires participants, collaborations internes facilitées, proposition d’organisation d’écoles thématiques et de conférence (Ecole d’été du CNRS, Conférence Jacques Monod), organisation annuelle de colloques gratuits, ouverts au grand public et aux collègues universitaires (sur inscription obligatoire), et, à échéances régulières, publications d’articles et d’ouvrages de synthèse.
Les colloques annuels tiendront un rôle structurant dans ce GDR parce que ceux-ci seront l’occasion d’étendre la liste des participants au GDR et de ses experts, sur la base des approches déjà identifiées comme fondatrices (approches juridiques, philosophiques, éthiques, scientifiques, artistiques et activités de vulgarisation). Pour cela, chaque contributeur du colloque de la première année sera invité à identifier et à nommer un collègue de sa propre spécialité, motivé par l’enjeu de ce GDR. Ce collègue sera à son tour invité comme orateur au colloque de la deuxième année, etc. Chaque année, les orateurs des années passés seront également conviés à participer au colloque de l’année en cours, et à y envoyer les membres de leurs laboratoires et leurs étudiants. Plus précisément, ces participants récurrents tiendront les rôles de ‘chairperson’ et de répondants scientifiques durant le colloque à venir. La venue de ces répondants scientifiques sera en partie facilitée par le financement REVMICNAT. Cependant, pour les répondants scientifiques qui le souhaiterait, une recherche de fonds additionnels sera engagée pour faciliter leur présence sur l’ensemble du colloque. La présence des invités de chaque nouvelle année, sélectionné par le comité scientifique du GDR REVMICNAT sera en revanche intégralement financée, pour toute la durée du projet, par le financement annuel REVMICNAT. Naturellement, chacun de ces colloques sera public (sur inscription gratuite), et ouvert en particulier aux doctorants et postdoctorants des disciplines concernées. Ces colloques feront de plus l’objet d’une publicité via les medias grands publics (radio, journaux scientifiques), car plusieurs membres du GDR entretiennent des contacts réguliers avec les medias. Les enregistrements des exposés seront également publiquement disponible sur le web. Cette démarche agrégative et ouverte contribuera ainsi à recenser les équipes et les chercheurs qui travaillent dans un secteur de recherche où la prise en compte des microbes et des savoirs autour des microbes est de nature à transformer les connaissances établies. Les objectifs de ce protocole de recherche seront donc doubles. D’une part, assurer le développement du réseau grâce aux contributions d’un ensemble renouvelé de contributeurs, dans un format favorisant la discussion et les rencontres entre chercheurs, doctorants et post-doctorants qui permettra d’ancrer les coopérations pluridisciplinaires. D’autre part, un large travail de synthèse sera accompli lors des 2ème, 4ème et 5ème années. Pour les deux premières échéances, ce travail de synthèse prendra en effet la forme d’au moins un article de revue pluridisciplinaire (publié en conformité avec les politiques de sciences ouvertes du CNRS), puis finalement d’un ouvrage collectif publié. Les collaborations pluridisciplinaires et interdisciplinaires entre au moins deux membres du GDR seront encouragées et soutenues dans la mesure des moyens financiers disponibles (en permettant les rencontres de travail, notamment).
Responsable : Fabrice Not
Aspects juridiques du microbiome : Géraldine Aïdan
Anthropologie et microbiomes : Frédéric Keck
Philosophie et microbiomes : Philippe Huneman
Coordination scientifique/animation : Eric Bapteste
Microbiologie environnementale et microbiomes : Catherine Larose
Arts et microbiome : FJ Lapointe et Liliane Campos
Santé et microbiome : Philippe Gérard
Holobiontes et microbiomes : Manuel Blouin
Architecture et microbiomes : Philippe Rahm
Diffusion scientifique et microbiomes : Marc-André Sélosse
Bioremédiation et microbiomes : Laura Hug
Provisional program ‘REVMICNAT 5th edition’:
9:00-9:05: A few welcome words. Dr. E. Bapteste (CNRS, ISYEB, Paris, France)
9:06-9:26: Today’s Biology: The microbiome within the microbiome. Dr. Eduardo Rocha (Pasteur, France)
9:27-9:47: Today’s Biology: Lessons from microbiomes from the past. Dr. Catherine Larose (CNRS-Université Grenoble Alpes, France)
9:48-10:08: Today’s Biology: Biodeterioration and microbiomes. Dr. Yvan Moënne-Loccoz (UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, UMR INRAe 1418 - VetAgro Sup, Université Lyon 1, Villeurbanne, France)
10:09-10:29: Today’s Biology: Holobionts and macroalgae. Dr. François Thomas (CNRS, Roscoff, France)
10:30-10:50: Today’s Biology: Addressing the role of perturbations in microbiome dynamics. Dr. Marco Fondi (Biology Dep., University of Florence, Italy)
5 minutes break
10:55-11:15: Politics : The geopolitics of microbes. Dr. Gitte du Plessis (Academy of Finland Research Fellow, Politics, Tampere University)
11:16-11:36: Religion : Religion, Animals, and the Theological Anthropology of Microbes in the Pandemicene. Dr. Aminah Al-Attas Bradford (Department of Applied Ecology, NC State University, USA)
11:37-11:57: Design: Fashion, bioactive textiles and microbiomes. Dr. Cláudia Suellen Ferro de Oliveira (CBQF - Centre for Biotechnology and Fine Chemistry, Universidade Católica Portuguesa, Porto, Portugal)
LUNCH BREAK (1h30 for all speakers)
13:30-13:50: Art: Doing art with microbiomes. Lise Leloutre (Beaux-Arts de Paris, Paris, France)
13:51-14:11: Art: Microbes, viruses and science-fiction. Marie Truffié (Graduated from L’Ecole des Arts Décoratifs de Paris, France)
14:12-14:32: Architecture: Microbiomes and the History of Architecture. Pr. Mark Wigley (Graduate School of Architecture, Planning, and Preservation, Columbia University, New York, USA)
14:33-14:53: Law sciences: Microbiomes and the evolution of laws. Dr. Laure Thomasset (Institut Catholique de Paris, Faculté de Sciences Sociales, d'Economie et de Droit (FASSED), France)
14:54-15:14: Today’s Biology: Person-to-person-microbiome transmission. Dr. Mireia Valles-Colomer (distancial) (Department of Medicine and Life Sciences UPF (MELIS-UPF), Barcelona, Spain)
15:15-15:35: Tomorrow’s Biology: Microbiomes and the plastisphere. Dr. Méril Massot (Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive, CNRS-UMR 5175, Montpellier, France)
5 minutes break
15:40-16:00: Philosophy: Responsibility and the Microbiome. Dr. Kristien Hens (University of Antwerp, Department of philosophy, Antwerpen. Belgium)
16:01-16:21: Tomorrow’s Biology: The impact of microbiome studies on astrobiology as a field. Dr. Michael Macey (School of Environment, Earth and Ecosystem Sciences, Faculty of Science, Technology, Engineering and Mathematics, The Open University, Milton Keynes, UK)
16:22-16:39: One spot to be funded by the GDR – for you, maybe? You can apply at epbapteste@gmail.com; your application will be evaluated by the Scientific Committee of Revmicnat
Liens
[1] https://evol-net.fr/2021/02/19/international-interdisciplinary-colloquium-new-challenges-induced-by-microbiomes/
[2] https://evol-net.fr/2021/10/07/new-challenges-induced-by-microbiomes-conference-2-october-4th-2021-paris/
[3] https://evol-net.fr/2022/10/06/new-challenges-induced-by-microbiomes-conference-3-october-4th-2022-paris/
[4] https://evol-net.fr/2023/10/02/new-challenges-induced-by-microbiomes-conference-4-september-15th-2023-paris/
[5] mailto:epbapteste@gmail.com