Source URL: https://www.sb-roscoff.fr/fr/laboratoire-de-biologie-integrative-des-modeles-marins/cmar/support-bioinformatique
Soutien en bioinformatique
Introduction:
Activité mutualisée et collaborative avec la plateforme de bioinformatique <a href="https://abims.sb-roscoff.fr/">ABiMS</a>
Texte du contenu:
- Infrastructure de calcul (cluster) et de stockage
- Outils et banques de données bioinformatiques (mutualisation avec l’Institut Français de Bioinformatique)
EXPERTISE - collaborations formalisées sous forme de projets
- Aide à l’analyse de données génomiques, transcriptomiques, metatranscriptomiques, metagenomiques, analyse de diversité et de population
- Environnements virtuels pour l’analyse, la visualisation, l’annotation de données « omics »
- Ingénierie logicielle, développement de bases de données et d’applications web
- Linux, utilisation du cluster, R, Galaxy, analyse de données RNA-Seq, git
Publié sur Station Biologique de Roscoff - CNRS - Sorbonne Université (https://www.sb-roscoff.fr)
Liens
[1] https://abims.sb-roscoff.fr/
[2] http://abims.sb-roscoff.fr/
[3] http://abims.sb-roscoff.fr/resources
[4] https://www.france-bioinformatique.fr/
[5] http://abims.sb-roscoff.fr/projects
[6] http://abims.sb-roscoff.fr/training