L'équipe explore différents niveaux de diversité:

- diversité intra-spécifique, forçage neutre ou adaptatif des polymorphismes

- hybridation et spéciation, contacts secondaires, barrières d'isolement et leurs évolutions

- diversité inter-spécifique et interactions, dynamique spatio-temporelle d'assemblages d'espèces dans des contextes urbanisés, exploités ou naturellement dynamiques

Nos recherches sont en grande partie basées sur des approches empiriques concernant diverses espèces marines choisies  en fonction des problèmes abordés. Certaines de ces espèces jouent un rôle clé dans le réseau trophique (par exemple, le krill), représentent des espèces ingénieures (polychètes alvinellidés, ascidies solitaires, macro-algues), sont des espèces exogènes (le mollusque Crepidula fornicata, l'ascidie Ciona robusta, l'algue Undaria pinnatifida), ou encore constituent des interactions durables (les bivalves Bathymodiolus, Loripes ou Ostrea).