Directeur.trice de recherche CNRS

Directrice adjointe LBI2M

Domaine de recherche : Glycobiologie Structurale

Alors que la glycobiologie attire l’attention des chercheurs depuis plusieurs décennies, elle reste un domaine de recherche encore ‘sous étudié’. Une des principales raisons, qui rend les analyses des glucides compliquées, comparées aux 3 autres grandes classes de macromolécules biologiques, est le fait qu’il n’existe pas de méthodes équivalentes au séquençage ni à la synthèse de gènes, méthodes qui ont permis l’accélération fulgurante à la biologie moléculaire et la génomique ces dernières trente années.

C’est dans ce contexte que je me suis, dans ma carrière, rapidement intéressée aux glucides, et aux enzymes et protéines interagissant avec les glucides.  Depuis plus de vingt ans, je m'investie dans l’analyse structurale et biochimique de glycoside-hydrolases et la glycobiologie structurale en générale. En particulier, je me suis intéressée aux facteurs structuraux gouvernant les mécanismes enzymatiques et la spécificité de substrats, car les enzymes, connaissant leurs caractéristiques biochimiques détaillées, représentent des outils potentiels précieux pour avancer les connaissances sur la nature, structure et le rôle des glucides dans les processus de la vie.

Aujourd’hui, le point fort de la recherche que je développe est l’identification et la caractérisation d’enzymes et d’autres acteurs protéiques impliqués dans le métabolisme des polysaccharides du milieu marin, en partant de protéines hypothétiques ou de fonction inconnu.

 

 

Publications

(selection of publications)

Dorival J, Ruppert S, Gunnoo M, Orłowski A, Chapelais-Baron M, Dabin J, Labourel A, Thompson D, Michel G, Czjzek M, Genicot S. (2018) The laterally acquired GH5 ZgEngAGH5_4 from the marine bacterium Zobellia galactanivorans is dedicated to hemicellulose hydrolysis. Biochem J. 475(22):3609-3628.

Matard-Mann M, Bernard T, Leroux C, Barbeyron T, Larocque R, Préchoux A, Jeudy A, Jam M, Nyvall Collén P, Michel G, Czjzek M. (2017) Structural insights into marine carbohydrate degradation by family GH16 κ-carrageenases. J Biol Chem. 292(48):19919-19934

Smith SP, Bayer EA, Czjzek M. (2017) Continually emerging mechanistic complexity of the multi-enzyme cellulosome complex. Current Opinion in Structural Biology, 44:151-160.

Ropartz D, Giuliani A, Fanuel M, Hervé C, Czjzek M, Rogniaux H (2016) Online coupling of high-resolution chromatography with extreme UV photon activation tandem mass spectrometry: Application to the structural investigation of complex glycans by dissociative photoionization. Anal Chim Acta. 933:1-9.

Ropartz D, Giuliani A, Hervé C, Geairon A, Jam M, Czjzek M, Rogniaux H. (2015) High-energy photon activation tandem mass spectrometry provides unprecedented insights into the structure of highly sulfated oligosaccharides extracted from macroalgal cell walls. Anal Chem. 87(2):1042-9.

Hehemann JH, Boraston AB, Czjzek M. (2014) A sweet new wave: structures and mechanisms of enzymes that digest polysaccharides from marine algae. Current Opinion in Structural Biology, 28C:77-86.

Thomas F, Lundqvist LC, Jam M, Jeudy A, Barbeyron T, Sandström C, Michel G, Czjzek M. (2013) Comparative Characterization of Two Marine Alginate Lyases from Zobellia galactanivorans Reveals Distinct Modes of Action and Exquisite Adaptation to Their Natural Substrate J Biol Chem. 288(32):23021-23037.

Hehemann J.H., Correc G., Barbeyron T., Helbert W., Czjzek M, Michel G. (2010) Transfer of carbohydrate-active enzymes from marine bacteria to Japanese gut microbiota. Nature, 464, 908-912.