Présentation de la plateforme
La plateforme CristalO se décompose en deux parties : cristallogenèse et cristallographie. Le 1er service concerne la réalisation de cristaux à partir d'une protéine soluble. L'identification des conditions de cristallisation est réalisée de façon automatique par un robot de cristallisation. Ensuite intervient une étape manuelle de reproduction et d'optimisation des cristaux. Le 2e service découle naturellement du 1er et concerne la diffraction des cristaux par les rayons X, la collecte des données, la détermination de la structure 3D et son affinement.
Un panel complet d’instruments pour la préparation des échantillons est disponible sur site (Appareil DLS Zetasizer, Caméra automatique CrysCamTM Digital Microscope System, Chambres réfrigérées, Diffractomètre à rayons X de type Bruker X8-Proteum, Robot nano-goutte multidistribution Crystal Gryphon et Source de rayons X microfocus).
Depuis janvier 2018, la plateforme de cristallographie fait partie de l'axe protéomique de Biogenouest.
La plateforme est une structure d'accès privilégiée pour les équipes de la Station Biologique de Roscoff. Elle est également ouverte aux établissements privés ou publics.
Sa mission première est de suivre et superviser la réalisation de projets nécessitant la cristallographie appliquée aux protéines, en définissant les modalités de collaboration avec les partenaires. Ceux-ci inclus:
- Étudier la faisabilité du projet et le développement méthodologique et fixer les priorités/devis sur demande
- Définir les moyens à mettre en œuvre
- Superviser la réalisation des projets
- Assurer la formation aux méthodes de cristallisation et d’affinement des structures
- Assurer le bon fonctionnement du parc d’équipements
- Produire les résultats sur mesure : des données brutes à leur traitement et interprétation pour des rapports finalisés
- Garantir la confidentialité des données et des résultats
- Détermination de l’état oligomérique d’un échantillon par DLS
- Cristallisation d’échantillon à l’aide d’un robot de cristallisation Crystal Gryphon
- Suivi de la cristallisation avec une caméra CrysCam et/ou binoculaire
- Reproduction et optimisation manuelle des conditions de cristallisation
- Détermination de la condition de stockage des cristaux dans l’azote liquide
- Diffraction des cristaux par les rayons X
- Collecte et traitement des données
- Phasage et reconstruction du modèle d’intérêt
Notre expertise porte sur des biomolécules, à savoir :
- Protéines solubles
- Complexes protéiques incluant des molécules hydrophiles et hydrophobes
- Complexes protéine-protéine
- Complexes protéine-acides nucléiques
Une démarche qualité est menée sur la plateforme avec la mise en place de nombreux protocoles et d'un système de gestion administratif de la plateforme.