Accès aux données

paramètres hydrologiques

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Données historiques - 1952 - 2000

SNO SOMLIT - Accès aux données

SNO SOMLIT - Visualisation de données

SNO COAST HF - Accès aux données

► Données historiques de température et de salinité de 1952 à 2000 - Astan-Large :

Les données historiques de température et de salinité acquises de 1952 à 2000 par la SBR au point Astan-Large sont disponibles dans le portail de données marines SEANOE (Sea Scientific Open Data Edition) via le lien suivant : https://www.seanoe.org/data/00847/95911/.

L’année 2000 marque l’intégration de cette station du large dans le Service National d’Observation SOMLIT sous le nom SOMLIT-Astan.

►SNO SOMLIT - Accès aux données basse fréquence (depuis 1997) - SOMLIT-Estacade et SOMLIT-Astan

L’intégralité des données acquises dans le cadre du SNO SOMLIT par la SBR (15 paramètres hydrologiques, pico/nano-plancton, profils CTD) aux points SOMLIT-Estacade (depuis 1997) et SOMLIT-Astan est accessible dans SEANOE : https://www.seanoe.org/data/00854/96634/.

Un outil de visualisation des données acquises et développées par le SNO SOMLIT est accessible : https://www.somlit.fr/visualisation-des-donnees/

►SNO COAST-HF - Accès aux données haute fréquence (depuis 2007) - Bouée cardinale Astan

communautés phytoplanctoniques

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Base de données Pelagos

SNO SOMLIT - Accès aux données

SNO PHYTOBS - Accès aux données

► Base de données PELAGOS (depuis 2000) :

Pico/nanophytoplancton : abondances des groupes fonctionnels - SOMLIT-Estacade et SOMLIT-Astan
Microphytoplancton : abondances spécifiques - SOMLIT-Astan
Microphytoplancton : listes floristiques semi-quantitatives (trait de filet, fraction >20µm) - SOMLIT-Astan.

► SNO SOMLIT - Accès aux données (depuis 2009) :

Pico/nanophytoplancton : abondances des groupes fonctionnels - SOMLIT-Estacade et SOMLIT-Astan.

► SNO PHYTOBS - Accès aux données (depuis 2000)

Microphytoplancton : abondances spécifiques - SOMLIT-Astan.

Les données historiques 2000 - 2017 ont été acquises antérieurement à la labellisation du SNO PHYTOBS, elles ne sont pas qualifiées. A partir de 2018, les données sont acquises dans la cadre du SNO PHYTOBS, elles sont labellisées et qualifiées.

Via le SNO PHYTOBS, toutes les données d'abondances du microphytoplancton sont associées aux paramètres environnementaux du SNO SOMLIT.

Visualisation de données - PHYTOBS SNO Data Viewer https://data.phytobs.fr/dash

Outil pour l’exploration visuelle des données produites par le SNO BENTHOBS développé au sein de la plateforme ABIMS - SBR dans le cadre du stage de fin d'études d'ingénieure géomaticienne à la Faculté des Sciences et d’Ingénierie de Tanger de F-E. EL HOUJJAJI (financement IR ILICO).

Marqueur ribosomal 18S V4 (eucaryotes) 2009 - 2016 - SOMLIT-Astan

18S V4 rDNA Raw sequences (Fastq) : European Nucleotide Archives - https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB48571
18S V4 rDNA Operational Taxonomic Units (OTUs) : ZENODO - https://doi.org/10.5281/zenodo.5032450
18S V4 rDNA ASV table (dada2) : ZENODO - https://doi.org/10.5281/zenodo.8392524

Publication ressource de la série : Caracciolo, M., Rigaut-Jalabert, F., Romac, S., Mahé, F., Forsans, S., Gac, J-P, Arsenieff, L., Manno, M., Chaffron, S., Cariou, T., Hoebeke, M., Bozec, Y., Goberville, E., Le Gall, F., Guilloux, L., Baudoux, A-C, de Vargas, C., Not, F., Thiébaut, E., Henry, N., Simon, N. (2022). Seasonal dynamics of marine protist communities in tidally mixed coastal waters. Molecular Ecology, 00, 1–23. https://doi.org/10.1111/mec.16539

communautés benthiques

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REBENT - Accès aux données

SNO BenthOBS - Accès aux données

► RÉseau de surveillance BENThique REBENT :

Les données acquises dans le cadre du REBENT sont accessibles via le portail Quadrige 2

► SNO BenthOBS - Accès aux données :

Données acquises dans le cadre du SNO BenthOBS aux points Pierre Noire : https://www.benthobs.fr/Stations/Pierre-Noire et Rivière de Morlaix : https://www.benthobs.fr/Stations/Riviere-de-Morlaix
L'intégralité des données acquises dans le cadre du SNO BenthOBS sont accessibles via le lien : https://www.benthobs.fr/Donnees
Visualisation de données - BenthOBS SNO Data Viewer - https://data.benthobs.fr/dash

Outil pour l’exploration visuelle des données produites par le SNO BENTHOBS développé au sein de la plateforme ABIMS - SBR dans le cadre du stage de fin d'études d'ingénieure géomaticienne à la Faculté des Sciences et d’Ingénierie de Tanger de F-E. EL HOUJJAJI (financement IR ILICO).

paramètres hydrologiques

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communautés phytoplanctoniques

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Communautés microbiennes pélagiques - données génétiques (metabarcoding)

communautés benthiques

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