Formation "Analyse RNAseq sous Galaxy" / 20 et 21 mai 2019

●     Objectif général :

connaître les principales méthodes et les principaux outils d’analyse de données RNAseq de novo ou avec génomes de référence.

●     Objectifs opérationnels : utiliser les outils d’analyse de données RNASeq dans l’environnement Galaxy :

- Évaluer la qualité du jeu de données brutes,

- mettre en place des stratégies de nettoyage du jeu de  données,

- assembler un jeu de données de novo et/ou remapper les jeux de données sur un génomes / transcriptome de référence,

- annoter un transcriptome,

- identifier les gènes différentiellement exprimés.