Biodiversité et dynamique des éléments transposables

Les éléments transposables (ETs) sont des constituants majeurs des génomes car ils ont un impact important à la fois sur leur structure et sur leur stabilité. Ils participent donc fortement à la diversité génétique et à l’évolution des organismes.

Ces éléments présentent une très grande biodiversité qui reste encore sous-estimé. L’étude de différents groupes d’ETs  au sein de taxons encore peu étudiés à ce jour (malacostracés, mollusques, annélides, champignon filamenteux) a permis de montrer que des clades de rétrotransposons (GalEa, DIRS1), jusqu’ici peu connus étaient en fait bien représentés au sein des métazoaires, voire au-delà. Une fois ces ETs caractérisés, l’analyse comparative de leur diversité et de leur distribution intra et/ou inter spécifique permet de mieux appréhender leur dynamique à large échelle (au sein de phylum).

La dynamique des ETs dépend également de leur réponse aux variations de l’environnement dont l’étude peut être menée à deux niveaux. (i) La génétique comparative permet de déterminer si les espèces vivant dans un écosystème hypervariable, comme les sources hydrothermales, présentent des caractéristiques particulières vis-à-vis des ETs. (ii) L’approche expérimentale permet de suivre directement la réponse du génome d’une espèce, l’anémone de mer Anemonia viridis, à un choc thermique (élévation de température de plus 10°C pouvant induire le blanchissement).