Ingénieur(e) de recherche

Projet Oceactif

Expérience professionnelle

INGENIEURE DE RECHERCHE PROJET OCEACTIF

Actuellement - UMI 3614 Station Biologique de Roscoff

  • Recherche et optimisation des conditions de culture de différentes souches de macroalgues
  • Identifications des espèces sélectionnées par barcoding afin d'assurer la traçabilité des échantillons récoltés pour la recherche d'actifs innovants

 

 

 

RESPONSABLE SITE PILOTE DE PRODUCTION D’ALGUES

Juin-Novembre 2016 - BRETALG Roscoff

• Conception, mise en œuvre et maintenance d’un site de production d’algues vertes à échelle pilote.

• Sélection de souches pour l’industrie alimentaire, mise en culture, optimisation, suivi et contrôle de la production (paramètres physico chimique, biomasse, qualité)

INGÉNIEURE BIOLOGIE MOLECULAIRE, BIOCHIMIE, ECOPHYSIOLOGIE -

Avril-Juillet 2015 CNRS Roscoff LBi2M

• Métabolisme des phlorotannins: Suivi de l’expression de gènes cibles et quantification de phlorotannins sur l’algue brune Fucus vesiculosus soumise au broutage en milieu naturel.

• Etude de voies de biosynthèses d’Ectocarpus: Caractérisation biochimique de protéines recombinantes (Chalcones isomérases-like)

DOCTORAT Biologie Marine CNRS Roscoff- UPMC LBi2M

2011-2015 Codirection  Philippe Potin, Erwan Ar Gall.

Sujet:  Etude de la voie de biosynthèse des phlorotannins chez les algues brunes, de la caractérisation de protéines recombinantes à l’étude des réponses écophysiologiques

•Etude de la voie de biosynthèse des phlorotannins chez Ectocarpus: Clonage, surexpression en système hétérologue bactérien, purification et caractérisation biochimique de protéines recombinantes.

• Etude du métabolisme des phlorotannins chez Fucus vesiculosus : Recherche et suivi de l’expression de gènes cibles, extraction et quantification de phlorotannins suite à différents conditionnements (broutage herbivores, radiations UV-B). Collaboration avec Erwan Ar Gall  au LEMAR IUEM (Brest) et séjour collaboratif avec Florian Weinberger GEOMAR Marine Ecology division (Kiel, Allemagne)

• Preuve de concept de la complémentation fonctionnelle d’un gène d’algue (Ectocarpus) dans une plante d’intérêt agronomique (Arabidopsis Thaliana). Séjour collaboratif avec Balakrishnan Prithiviraj au Department of Plant, Food, and Environmental Sciences (Truro, Canada).

Compétences

Culture d’algues

• Sélection phénotypique, mise en culture, suivi de production à échelle pilote d’algues pour l’industrie alimentaire appliqué à Ulva rigida

• Orientation métabolique, conditionnement : Etude du métabolisme des phlorotannins chez Fucus vesiculosus

Biologie moléculaire

• Extraction et purification d’ADN et d’ARN d’algues brunes

• Design de primers - Alignement et analyse de séquences - BLAST - Séquençage

• Transcriptomique  PCR quantitative – PCR- 5’ 3’ RACE - Electrophorèse

• Clonage - Transformation bactérienne Escherichia coli, Agrobacterium - Clonage Gateway

Biochimie

• Extraction organique en phase liquide - sur phase solide de phlorotannins d’algues brunes Quantification par méthodes de Folin et DMACA - Dérivation TMS - Analyses GC-MS, LC-MS.

• Protéines recombinantes d’algue brune: Surexpression en système hétérologue bactérien - Purification par chromatographie d’affinité - gel filtration - Electrophorèse - Thermophorèse - GC-MS, LC-MS.

 

Publications

Creis E., Ar Gall E., Potin P. Ubiquitous Phlorotannins, prospects en perspectives.(2018) Blue Biotechnology: Production and Use of Marine Molecules, Wiley

Creis E., Delage L., Charton S., Goulitquer S., Leblanc C., Potin P., Ar Gall E. (2015) Constitutive or inducible protective mechanisms against UV-B radiation in the brown alga Fucus vesiculosus ? A study of gene expression and phlorotannin content responses. PloS One, 10(6), e0128003.

Meslet-Cladiere, L., Delage, L., Leroux, C. J.-J., Goulitquer, S., Leblanc, C., Creis, E., Ar Gall, E., Stiger, V., Czjzek, M., Potin, P. (2013) Structure/Function analysis of a type III Polyketide synthase in the brown alga Ectocarpus siliculosus reveals a biochemical pathway in phlorotannin monomer biosynthesis. The Plant Cell, 25; 3089_3103.